Peptid - Peptide

Tetrapeptid (příklad Val - Gly - Ser - Ala ) se zelenou označené amino konec ( L-valin ) a
modrý výrazný karboxylový konec ( L-alaninu ).

Peptidy (z řeckého jazyka πεπτός, peptós „strávený“; odvozeno z πέσσειν, péssein „strávit“)ou krátké řetězce aminokyselin spojených peptidovými vazbami . Řetězy s méně než deseti nebo patnácti aminokyselinami se nazývají oligopeptidy a zahrnují dipeptidy, tripeptidy a tetrapeptidy .

Polypeptid je delší, kontinuální, nerozvětvený peptidový řetězec. Peptidy tedy spadají do široké chemické třídy biologických polymerů a oligomerů, vedle nukleových kyselin, oligosacharidů, polysacharidů a dalších.

Polypeptid, který obsahuje více než přibližně padesát aminokyselin, je známý jako protein . Proteiny se skládají z jednoho nebo více polypeptidů uspořádaných biologicky funkčním způsobem, často vázaných na ligandy, jakoou koenzymy a kofaktory, nebo na jiný protein nebo jinou makromolekulu, jako je DNA nebo RNA, nebo na komplexní makromolekulární sestavy .

Aminokyseliny, které byly začleněny do peptidů, se nazývají zbytky . Při tvorbě každé amidové vazby se uvolňuje molekula vody . Všechny peptidy kromě cyklických peptidů mají N-koncový (aminová skupina) a C-koncový (karboxylová skupina) zbytek na konci peptidu (jak je ukázáno pro tetrapeptid na obrázku).

Třídy

Je známo mnoho druhů peptidů. Byly klasifikovány nebo roztříděny podle jejich zdrojů a funkcí. Podle Příručky biologicky aktivních peptidů některé skupiny peptidů zahrnují rostlinné peptidy, bakteriální/ antibiotické peptidy, fungální peptidy, bezobratlé peptidy, obojživelníky/kožní peptidy, jedové peptidy, rakovinné/protirakovinové peptidy, vakcinační peptidy, imunitní/zánětlivé peptidy, mozek peptidy, endokrinní peptidy, polykací peptidy, gastrointestinální peptidy, kardiovaskulární peptidy, renální peptidy, respirační peptidy, opiátové peptidy, neurotrofní peptidy a hematoencefalické peptidy.

Některé ribozomální peptidy podléhají proteolýze . Ty fungují, obvykle ve vyšších organismech, jako hormony a signální molekuly. Některé organismy produkují peptidy jako antibiotika, jakoou mikrociny a bakteriociny .

Peptidy mají často posttranslační modifikace, jako je fosforylace, hydroxylace, sulfonace, palmitoylace, glykosylace a tvorba disulfidů . Peptidyou obecně lineární, i když byly pozorovány lariatické struktury. Dochází k exotičtějším manipulacím, jako je racemizace L-aminokyselin na D-aminokyseliny v jedu ptakopysků .

Nonribozomální peptidyou sestaveny enzymy, nikoli ribozomem. Běžným neribozomálním peptidem je glutathion, součást antioxidační obrany většiny aerobních organismů. Jiné nebribozomální peptidyou nejběžnější v jednobuněčných organismech, rostlinách a houbách aou syntetizovány modulárními enzymatickými komplexy nazývanými nerobozomální peptid syntetázy .

Tyto komplexyou často rozloženy podobným způsobem a mohou obsahovat mnoho různých modulů k provádění různorodé sady chemických manipulací s vyvíjejícím se produktem. Tyto peptidyou často cyklické a mohou mít velmi složité cyklické struktury, ačkoli běžnéou také lineární nepribozomální peptidy. Protože je systém úzce spjat se strojním zařízením na výrobu mastných kyselin a polyketidů, často se vyskytují hybridní sloučeniny. Přítomnost oxazolů nebo thiazolů často naznačuje, že sloučenina byla syntetizována tímto způsobem.

Peptony pocházejí ze zvířecího mléka nebo masa natráveného proteolýzou . Výsledný materiál kromě malých peptidů obsahuje tuky, kovy, soli, vitamíny a mnoho dalších biologických sloučenin. Peptony se používají v živných médiích pro pěstování bakterií a hub.

Peptidové fragmenty se týkají fragmentů proteinů, které se používají k identifikaci nebo kvantifikaci zdrojového proteinu. Často se jedná o produkty enzymatické degradace prováděné v laboratoři na kontrolovaném vzorku, ale mohou to být také forenzní nebo paleontologické vzorky, které byly degradovány přírodními vlivy.

Chemická syntéza

Syntéza peptidů na pevné fázi na amidové kluziště pryskyřice za použití Fmoc a- aminu chráněného aminokyselinu

Příklad rodiny

Peptidové rodiny v této sekciou ribozomální peptidy, obvykle s hormonální aktivitou. Všechny tyto peptidyou syntetizovány buňkami jako delší "propeptidy" nebo "proproteiny" a zkráceny před opuštěním buňky.ou uvolňovány do krevního oběhu, kde plní své signalizační funkce.

Antimikrobiální peptidy

• Magaininova rodina
• Rodina Cecropinů
• Rodina kathelicidinů
• Defensin rodina

Tachykininové peptidy

• Látka P
• Kassinin
• Neurokinin A.
• Eledoisin
• Neurokinin B

Vazoaktivní střevní peptidy

• VIP ( V asoactive I ntestinal P eptide ; PHM27)
• PACAP P ituitary denylate C yclase AKTIVACE P eptide
• Peptid PHI 27 ( P eptide H istidine I soleucine 27 )
• GHRH 1-24 ( G rowth H ormone R eleasing H ormone 1-24)
• Glukagon
• Secretin

Peptidy související s pankreatickými polypeptidy

• NPY ( N euro P eptide Y )
• PYY ( P eptide YY )
• APP ( Vian P ancreatic P olypeptide)
• PPY P ancreatic P ol Y peptid

Opioidní peptidy

• Peptidy proopiomelanocortinu (POMC)
• Enkefalinové pentapeptidy
• Prodynorfinové peptidy

Kalcitoninové peptidy

• Kalcitonin
• Amylin
• AGG01

Samoskladné peptidy

• Aromatické krátké peptidy
• Biomimetické peptidy
• Peptidové amfifily
• Peptidové dendrimery

Jiné peptidy

• Natriuretický peptid typu B (BNP) - vyrábí se v myokardu a je užitečný při lékařské diagnostice
• Laktotripeptidy - Laktotripeptidy mohou snižovat krevní tlak, i když důkazyou smíšené.
• Peptidické složky z tradiční čínské medicíny Colla Corii Asini v krvetvorbě.

Terminologie

Délka

Několik termínů souvisejících s peptidy nemá žádnou přesnou definici délky a jejich použití se často překrývá.

• Polypeptid je jeden lineární řetězec mnoha aminokyselin (všechna délka), držených dohromady amidovými vazbami .
• Protein se skládá z jednoho nebo více polypeptidů (více než přibližně 50 aminokyselin).
• Oligopeptid se skládá pouze z několika aminokyselin (mezi dvěma a dvaceti).

Tripeptid (příklad Val - Gly - Ala ) se
zeleně označeným amino koncem ( L -valin ) a
modře označeným karboxylovým koncem ( L -alanin )

Počet aminokyselin

Peptidy definované délkyou pojmenovány pomocí numerických multiplikátorových předpon IUPAC .

• Monopeptide má jednu aminokyselinu.
• Dipeptid má dvě aminokyseliny.
• Tripeptid má tři aminokyseliny.
• Tetrapeptid má čtyři aminokyseliny.
• Pentapeptid má pět aminokyselin.
• Hexapeptid má šest aminokyselin.
• Heptapeptid má sedm aminokyselin.
• Oktapeptid má osm aminokyselin ( např, angiotensin II ).
• Nonapeptid má devět aminokyselin ( např, oxytocin ).
• Dekapeptid má deset aminokyselin ( např, hormonu uvolňujícího gonadotropin a angiotensin I ).

Funkce

• Neuropeptid je peptid, který je aktivní ve spojení s nervové tkáni.
• Lipopeptid je peptid, který má lipid spojený s ní, a pepducinsou lipopeptidy, které interagují s GPCR.
• Peptidový hormon, je peptid, který působí jako hormon .
• Proteózy je směs peptidů hydrolýzou proteinů. Termín je poněkud archaický.
• Peptidergic činidlo (nebo léčiva) je chemikálie, která funguje na přímo modulovat peptidové systémy v těle nebo mozku. Příklademou opioidergika, cožou neuropeptidergika .
• Buněčný penetrační peptid je peptid schopný proniknout buněčnou membránou.

Viz také

Reference