Peptidi - Peptide

Tetrapeptidin (esimerkiksi Val - Gly - Ser - Ala ), joissa vihreällä merkityt aminopäästä ( L-valiini ) ja
sininen merkitty karboksyylipään ( L-alaniini ).

Peptidit ( kreikan kielestä πεπτός, peptós "digestoitu"; johdettu sanasta πέσσειν, péssein "sulattamaan") ovat lyhyitä aminohappoketjuja, jotka on kytketty peptidisidoksilla . Alle kymmenen tai viidentoista aminohapon ketjuja kutsutaan oligopeptideiksi, ja niihin kuuluvat dipeptidit, tripeptidit ja tetrapeptidit .

Polypeptidi on pidempi, jatkuva, haarautumaton peptidiketjuun. Siksi peptidit kuuluvat biologisten polymeerien ja oligomeerien laajaan kemialliseen luokkaan nukleiinihappojen, oligosakkaridien, polysakkaridien ja muiden rinnalla .

Polypeptidi, joka sisältää yli viisikymmentä aminohappoa, tunnetaan proteiinina . Proteiinit koostuvat yhdestä tai useammasta polypeptidistä, jotka on järjestetty biologisesti toiminnallisella tavalla ja jotka ovat usein sitoutuneet ligandeihin, kuten koentsyymeihin ja kofaktoreihin, tai toiseen proteiiniin tai muuhun makromolekyyliin, kuten DNA: han tai RNA: han, tai monimutkaisiin makromolekyylikokoonpanoihin .

Peptideihin sisällytettyjä aminohappoja kutsutaan tähteiksi . Jokaisen amidisidoksen muodostumisen aikana vapautuu vesimolekyyli . Kaikilla peptideillä paitsi syklisillä peptideillä on N-terminaalinen (amiiniryhmä) ja C-terminaalinen (karboksyyliryhmä) tähde peptidin päässä (kuten kuvassa esitetyssä tetrapeptidissä).

Luokat

Tunnetaan monenlaisia ​​peptidejä. Ne on luokiteltu tai luokiteltu niiden lähteiden ja toimintojen mukaan. Biologisesti aktiivisten peptidien käsikirjan mukaan joitakin peptidiryhmiä ovat kasvipeptidit, bakteeri-/ antibioottipeptidit, sienipeptidit, selkärangattomat peptidit, sammakkoeläinten/ihon peptidit, myrkkypeptidit, syöpä-/syöpälääkkeen peptidit, rokotepeptidit, immuuni-/tulehduspeptidit, aivot peptidejä, endokriinisiä peptidejä, nauttivia peptidejä, ruoansulatuskanavan peptidejä, sydän- ja verisuonipeptidejä, munuaispeptidejä, hengityspeptidejä, opiaattipeptidejä, neurotrofisia peptidejä ja veri -aivopeptidejä.

Jotkut ribosomaaliset peptidit altistuvat proteolyysille . Nämä toimivat tyypillisesti korkeammissa organismeissa hormoneina ja signaloivina molekyyleinä. Jotkut organismit tuottavat peptidejä antibiooteina, kuten mikrosiinejä ja bakteriosiineja .

Peptideillä on usein translaation jälkeisiä modifikaatioita, kuten fosforylaatio, hydroksylaatio, sulfonointi, palmitoylaatio, glykosylaatio ja disulfidin muodostuminen. Yleensä peptidit ovat lineaarisia, vaikka lariat -rakenteita on havaittu. Eksoottisempia manipulaatioita esiintyy, kuten L-aminohappojen rasemoituminen D-aminohapoiksi platypus-myrkyssä .

Nonribosomaaliset peptidit kootaan entsyymeillä, ei ribosomilla. Yleinen ei-ribosomaalinen peptidi on glutationi, joka on osa useimpien aerobisten organismien antioksidanttisuojaa . Muut ei -ribosomaaliset peptidit ovat yleisimpiä yksisoluisissa organismeissa, kasveissa ja sienissä, ja ne syntetisoidaan modulaarisilla entsyymikomplekseilla, joita kutsutaan ei -ribosomaalisiksi peptidisyntetaaseiksi .

Nämä kompleksit on usein järjestetty samalla tavalla, ja ne voivat sisältää monia eri moduuleja kehitettävän tuotteen erilaisten kemiallisten manipulaatioiden suorittamiseksi. Nämä peptidit ovat usein syklisiä ja niillä voi olla erittäin monimutkaisia ​​syklisiä rakenteita, vaikka myös lineaariset ei -ribosomaaliset peptidit ovat yleisiä. Koska järjestelmä liittyy läheisesti rasvahappojen ja polyketidien rakennuskoneisiin, löytyy usein hybridiyhdisteitä. Oksatsolien tai tiatsolien läsnäolo osoittaa usein, että yhdiste syntetisoitiin tällä tavalla.

Peptonit ovat peräisin eläinmaidosta tai lihasta, joka on pilkottu proteolyysillä . Tuloksena oleva materiaali sisältää pienten peptidien lisäksi rasvoja, metalleja, suoloja, vitamiineja ja monia muita biologisia yhdisteitä. Peptoneja käytetään ravinteissa bakteerien ja sienien kasvattamiseen.

Peptidifragmentit viittaavat proteiinifragmentteihin, joita käytetään lähdeproteiinin tunnistamiseen tai kvantifiointiin. Usein nämä ovat entsymaattisen hajoamisen tuotteita, jotka on suoritettu laboratoriossa kontrolloidulle näytteelle, mutta ne voivat olla myös rikosteknisiä tai paleontologisia näytteitä, jotka ovat hajonneet luonnollisista vaikutuksista.

Kemiallinen synteesi

Kiinteän faasin peptidisynteesi on Rink Amide -hartsi käyttäen Fmoc -α- amiini -suojatun aminohapon

Esimerkki perheistä

Tämän osan peptidiperheet ovat ribosomaalisia peptidejä, joilla on yleensä hormonaalista aktiivisuutta. Kaikki nämä peptidit syntetisoidaan soluissa pidempinä "propeptideinä" tai "proproteiineina" ja katkaistaan ​​ennen solusta poistumista. Ne vapautuvat verenkiertoon, missä ne suorittavat signalointitoimintonsa.

Antimikrobiset peptidit

• Magainin perhe
• Cecropin -perhe
• Cathelicidin -perhe
• Defensinin perhe

Tachykinin -peptidit

• Aine P
• Kassinin
• Neurokiniini A
• Eledoisin
• Neurokiniini B

Vasoaktiiviset suoliston peptidit

• VIP ( V asoactive I ntestinal P eptide ; PHM27)
• PACAP P ituitary A denylate C yclase A ctivating P eptide
• Peptidi PHI 27 ( P -peptidi H -istidiini I -boleusiini 27 )
• GHRH: n 1-24 ( G KASVU H ormone R eleasing H ormone 1-24)
• Glukagoni
• Secretin

Haiman polypeptidiin liittyvät peptidit

• NPY ( N euro P eptidi Y )
• PYY ( p eptidi YY )
• APP ( A vian P ancreatic P olypeptide)
• PPY P ancreatic P ol Y peptidin

Opioidipeptidit

• Proopiomelanokortiini (POMC) -peptidit
• enkefaliiniksi pentapept
• Prodynorphin peptidit

Kalsitoniinipeptidit

• Kalsitoniini
• Amylin
• AGG01

Itse kokoontuvat peptidit

• Aromaattiset lyhyet peptidit
• Biomimeettiset peptidit
• Peptidi -amfifiilit
• Peptididendrimerit

Muut peptidit

• B -tyypin natriureettinen peptidi (BNP) - tuotettu sydänlihaksessa ja hyödyllinen lääketieteellisessä diagnoosissa
• Laktotripeptidit - Laktotripeptidit voivat alentaa verenpainetta, vaikka todisteet ovat ristiriitaisia.
• Peptidiset komponentit perinteisestä kiinalaisesta lääketieteestä Colla Corii Asini hematopoieesissa.

Terminologia

Pituus

Useilla peptideihin liittyvillä termeillä ei ole tarkkoja pituuden määritelmiä, ja niiden käyttö on usein päällekkäistä.

• Polypeptidi on yksi lineaarinen ketju monia aminohappoja (kaikki pituus), pidetään yhdessä amidisidoksilla .
• Proteiini koostuu yhden tai useamman polypeptidin (enemmän kuin noin 50 aminohappoa pitkä).
• Oligopeptidi koostuu vain muutaman aminohapon (kahden ja kahdenkymmenen).

Tripeptidi (esimerkki Val - Gly - Ala ), jossa on
vihreä merkitty aminopää ( L -valiini ) ja
sininen merkitty karboksyylipää ( L -alaniini )

Aminohappojen lukumäärä

Määritetyn pituiset peptidit nimetään käyttämällä IUPAC -numeerisia kertojaetuliitteitä .

• Monopeptide on yksi aminohappo.
• Dipeptidi on kaksi aminohappoa.
• Tripeptidi on kolme aminohappoa.
• Tetrapeptidi on neljä aminohappoa.
• Pentapeptidin on viisi aminohappoa.
• Heksapeptidin on kuusi aminohappoa.
• Heptapeptidiksi on seitsemän aminohappoa.
• Oktapeptidistä on kahdeksan aminohappoa ( esim, angiotensiini II ).
• Nonapeptidi on yhdeksän aminohappoa ( esim, oksitosiini ).
• Dekapeptidi on kymmenen aminohappoa ( esim, gonadotropiinia vapauttava hormoni ja angiotensiini I ).

Toiminto

• Neuropeptidi on peptidi, joka on aktiivinen yhdessä hermokudoksessa.
• Lipopeptidi on peptidi, joka on lipidi kytketty siihen, ja pepducins ovat lipopeptidejä, jotka ovat vuorovaikutuksessa GPCR.
• Peptidi hormoni on peptidi, joka toimii hormoni .
• Proteoosipeptonia on peptidien seoksen tuotettu proteiinien hydrolyysiin. Termi on hieman arkaainen.
• Peptidergiset aine (tai lääke) on kemikaali, joka toimii suoraan moduloida peptidin kehon järjestelmien tai aivoissa. Esimerkki on opioidergiset lääkkeet, jotka ovat neuropeptidilääkkeitä .
• Soluja läpäisevä peptidi on peptidi, joka kykenee läpäisemään solukalvon.

Katso myös

Viitteet