Salmonella enterica subsp. enterica -Salmonella enterica subsp. enterica
| Salmonella enterica subsp. enterica | |
|---|---|
|
|
| Salmonella Typhimurium -pesäkkeitä Hektoen -enteropäällysteellä | |
Tieteellinen luokittelu 
|
|
| Verkkotunnus: | Bakteerit |
| Pylum: | Proteobakteerit |
| Luokka: | Gammaproteobakteerit |
| Tilaus: | Enterobacterales |
| Perhe: | Enterobacteriaceae |
| Suku: | Salmonella |
| Laji: | |
| Alalaji: |
S. e. subsp. enterica
|
| Kolminaisuuden nimi | |
|
Salmonella enterica subsp. enterica |
|
Salmonella enterica subsp. enterica on alalaji on Salmonella enterica, sauvan muotoinen, flagelloitu-, aerobinen, gram-negatiivinen bakteeri . Monet S. enterica -lajinpatogeenisistä serovarsista kuuluvattähän alalajiin, mukaan lukien lavantauti .
Serovarit
S. enterica subsp. enterica sisältää suuren määrän serovaria, jotka voivat tartuttaa monenlaisia selkärankaisia isäntiä. Yksittäiset jäsenet vaihtelevat hyvin isäntään sopeutuneista (kykenevät tartuttamaan vain kapeita lajeja) laajaan isäntäalueeseen. Tällä hetkellä serotyyppien erottamiseksi käytetään useita tekniikoita . Näitä ovat antigeenien läsnäolon tai puuttumisen etsiminen, faagityypitys, molekyylisormenjälkien ottaminen ja biotyyppien määrittäminen, jolloin serovarot erottuvat toisistaan sen mukaan, mitkä ravinteet ne pystyvät käymään. Mahdollinen tekijä tiettyjen serovarsien isäntäalueen määrittämisessä on faagivälitteinen pienen määrän geneettisten elementtien hankkiminen, jotka mahdollistavat tietyn isännän tartunnan. Lisäksi oletetaan, että kapeaa lajia tartuttavat serovarot ovat poikenneet esi -isistä, joilla on laaja isäntäalue, ja ovat sittemmin erikoistuneet ja menettäneet kykynsä tartuttaa joitain isäntiä.
Valikoima serovareja, joiden tunnetut isännät on lueteltu. Koska Salmonella enterica subsp. enterica, tämä luettelo on epätäydellinen.
| Serovar | Isäntälaji |
|---|---|
| Salmonella Choleraesuis | Sika |
| Salmonella Dublin | Nauta |
| Salmonella Enteritidis | Ihmiset, jyrsijät, galliformes |
| Salmonella Gallinarum | Galliformes |
| Salmonella Hadar | Ihmiset, galliformes, kanit |
| Salmonella Heidelberg | Ihmiset, galliformes, sika |
| Salmonella Infantis | Ihmiset, siipikarja |
| Salmonella Paratyphi | Ihmiset |
| Salmonella Typhi | Ihmiset |
| Salmonella Typhimurium | Ihmiset, naudat, siat, lampaat, hevoset, jyrsijät, galliformes |
Tutkimuksessa 37 maasta vuosina 2001–2007 kerättyjen tietojen mukaan yleisin ihmisen tapauksista eristetty salmonellan serovari oli Enteritidis, joka todettiin keskimäärin 43,5% tapauksista, ja sen jälkeen typhimurium (17,1% tapauksista), Newport (3,5) %), Infantis (1,8%), Virchow (1,5%), Hadar (1,5%) ja Agona (0,8%).
Yksi Yhdysvalloissa äskettäin ilmaantunut salmonellan kanta on S. enterica ser. Javiana. "Taudinpurkaus tapahtui vuonna 2002, 141 tapausta esiintyi Yhdysvaltain elinsiirtopelien osallistujien keskuudessa. 141 tapauksesta suurin osa tapauksista oli joko elinsiirtoa saaneita (34%) tai immunosuppressiivista hoitoa saavia henkilöitä (32%)." . CDC : n kansallinen antimikrobisen resistenssin seurantajärjestelmä on tunnistanut yhä useamman salmonellan serotyypin, joka on monilääkeresistentti (MDR) . " Salmonella Javiana [ sic ] aiheuttaa vuosittain 4% ei-tyypin salmonellatartunnoista Yhdysvalloissa."
Marraskuussa 2016 Pakistaniin ilmestyi uusi, laajalti lääkeresistentti (XDR) Salmonella enterica serovar Typhi -kanta lähinnä Hyderabadin ja Karachin kaupungeista . Monilääkeresistenttejä kantoja on esiintynyt Afrikassa ja Aasiassa 1970 -luvun lopulta lähtien. Nämä XDR-kannat kestävät kaikkia antibioottihoitovaihtoehtoja: kloramfenikolia, ampisilliinia, trimetopriimisulfametoksatsolia, fluorokinoloneja ja kolmannen sukupolven kefalosporiineja . Tauti on jatkunut vuodesta 2016.
Aineenvaihdunta
Geneettiset todisteet viittaavat siihen, että serovars voidaan jakaa kahteen ryhmään - yksi, joka aiheuttaa suolistotulehduksen ja jolla on laaja valikoima aineenvaihduntakykyjä, ja toinen, joka yleensä aiheuttaa invasiivisen infektion, usein kapealla isäntäalueella, ja osoittaa anaerobisten aineenvaihduntareittien hajoamista . Uskotaan, että nämä aineenvaihduntaominaisuudet ovat tärkeitä ravinteiden saamiseksi haastavassa ja ravinteiden rajallisessa tulehtuneessa suolistoympäristössä.
Nimikkeistö
Serovarit voidaan nimetä kokonaan tai lyhennettynä. Lyhyt muoto luettelot sukuun, Salmonella, joka seuraa aktivoidut ei kursivoida serovar, esimerkiksi Salmonella Typhi ottaa huomioon, täysi nimeäminen Salmonella Typhi on Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi. Jokaisella serovarilla voi olla myös monia kantoja, mikä mahdollistaa antigeenisesti vaihtelevien bakteerien kokonaismäärän nopean kasvun .
Epidemiologia
Ei-typhoidaalisen Salmonellan, kuten Salmonella Typhimurium ST313: n, invasiiviset kannat on äskettäin leimattu aiheuttaviksi uusiksi sairauksiksi Afrikassa. Keskeiset isännän immuunipuutokset, jotka liittyvät HIV: hen, malariaan ja aliravitsemukseen, ovat edistäneet tämän taudin laajaa leviämistä ja tarvetta käyttää kalliita mikrobilääkkeitä maailman köyhimmissä terveyspalveluissa. Mutta myös bakteeritekijöillä, kuten virulenssigeenin pgtE tehostetulla aktiivisuudella, johtuen yksittäisestä nukleotidipolymorfismista (SNP) sen promoottorialueella, on osoitettu olevan suuri vaikutus tämän salmonellasekvenssityypin patogeneesiin .