Salmonella enterica subsp. enterica -Salmonella enterica subsp. enterica
| Salmonella enterica subsp. enterica | |
|---|---|
|
|
| Salmonella Typhimurium -kolonier på en Hektoen enterisk agarplatta | |
Vetenskaplig klassificering 
|
|
| Domän: | Bakterie |
| Provins: | Proteobakterier |
| Klass: | Gammaproteobakterier |
| Beställa: | Enterobacterales |
| Familj: | Enterobacteriaceae |
| Släkte: | Salmonella |
| Arter: | |
| Underarter: |
S. e. subsp. enterica
|
| Trinomialt namn | |
|
Salmonella enterica subsp. enterica |
|
Salmonella enterica subsp. enterica är en underart av Salmonella enterica, den stavformade, flagellerade, aeroba, gramnegativa bakterien . Många av de patogena serovarna av S. enterica -arterna finns i denna underart, inklusive den som är ansvarig för tyfus .
Serovarer
S. enterica subsp. enterica innehåller ett stort antal serovarer som kan infektera ett brett spektrum av ryggradsdjur . De enskilda medlemmarna sträcker sig från att vara mycket värdanpassade (endast kunna infektera ett smalt sortiment) till att visa ett brett värdintervall. Ett antal tekniker används för närvarande för att skilja mellan serotyper . Dessa inkluderar att leta efter närvaro eller frånvaro av antigener, fagskrivning, molekylärt fingeravtryck och biotyp, där serovarer differentieras med vilka näringsämnen de kan jäsa. En möjlig faktor för att bestämma värdintervallet för särskilda serovarer är fagmedierat förvärv av ett litet antal genetiska element som möjliggör infektion av en viss värd. Det postuleras vidare att serovarer som infekterar ett smalt sortiment har avvikit från förfäder med ett brett värdintervall och har sedan dess specialiserat sig och förlorat förmågan att infektera några värdar.
Ett urval av serovarer, med kända värdar listade. Eftersom det finns mer än 2500 serovarer av Salmonella enterica subsp. enterica, listan är ofullständig.
| Serovar | Värdarter |
|---|---|
| Salmonella Choleraesuis | Svin |
| Salmonella Dublin | Nötkreatur |
| Salmonella Enteritidis | Människor, gnagare, galliformes |
| Salmonella Gallinarum | Galliformes |
| Salmonella Hadar | Människor, galliformes, kaniner |
| Salmonella Heidelberg | Människor, galliformes, svin |
| Salmonella Infantis | Människor, fjäderfä |
| Salmonella Paratyphi | Människor |
| Salmonella Typhi | Människor |
| Salmonella Typhimurium | Människor, boskap, svin, får, hästar, gnagare, galliformes |
En studie med data från 37 länder som samlats in mellan 2001 och 2007 visade att den vanligaste serovaren av Salmonella isolerad från mänskliga fall var Enteritidis, som hittades i genomsnitt 43,5% av fallen, följt av Typhimurium (17,1% av fallen), Newport (3,5 %), Infantis (1,8%), Virchow (1,5%), Hadar (1,5%) och Agona (0,8%).
En stam av Salmonella som nyligen har dykt upp i USA är S. enterica ser. Javiana. "Ett utbrott inträffade 2002, det var 141 fall som inträffade bland deltagarna i de amerikanska transplantationsleken. Av de 141 fallen var de flesta fall antingen transplantatmottagare (34%) eller personer som fick immunsuppressiv behandling (32%)" . Det finns ett ökande antal Salmonella -serotyper som är multiresistenta (MDR), vilket identifierades av CDC : s nationella system för övervakning av antimikrobiell resistens. " Salmonella Javiana [ sic ] orsakar 4% av icke-tyfodiala salmonellainfektioner i USA varje år."
I november 2016 uppstod en ny stam av omfattande läkemedelsresistenta (XDR) Salmonella enterica serovar Typhi i Pakistan, främst från städerna Hyderabad och Karachi . Multiresistenta stammar har funnits sedan slutet av 1970 -talet i Afrika och Asien. Dessa XDR-stammar är resistenta mot alla antibiotikabehandlingsalternativ: kloramfenikol, ampicillin, trimetoprim-sulfametoxazol, fluorokinoloner och tredje generationens cefalosporiner . Utbrottet har pågått sedan 2016.
Ämnesomsättning
Genetiska bevis tyder på att serovarna kan delas in i två grupper - en som orsakar enterisk infektion och har en bred repertoar av metaboliska förmågor, och en som vanligtvis orsakar invasiv infektion, ofta i ett smalt spektrum av värdar, och visar nedbrytning av anaeroba metaboliska vägar . Man tror att dessa metaboliska förmågor är viktiga för att få näringsämnen i den utmanande och näringsbegränsade inflammerade tarmmiljön.
Nomenklatur
Serovarna kan betecknas helt eller i förkortad form. Den korta formen listar släktet, Salmonella, som fö av den verserade, inte kursiverade serovaren, t.ex. Salmonella Typhi medan full beteckning för Salmonella Typhi är Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi. Varje serovar kan också ha många stammar, vilket möjliggör en snabb ökning av det totala antalet antigeniskt variabla bakterier.
Epidemiologi
Invasiva stammar av icke-tyfoidal salmonella, såsom Salmonella Typhimurium ST313, har nyligen märkts som orsakar nya sjukdomar i Afrika. Viktiga värdimmunbrister i samband med hiv, malaria och undernäring har bidragit till en stor spridning av denna sjukdom och behovet av att använda dyra antimikrobiella läkemedel i de fattigaste hälsovårdstjänsterna i världen. Men också bakteriefaktorer, såsom uppreglerad aktivitet av virulensgenen pgtE, på grund av en enda nukleotidpolymorfism (SNP) i dess promotorregion, har visat sig ha stor inverkan på patogenesen av denna specifika Salmonellasekvenstyp .