peptit - Peptide

Bir tetrapeptid (örneğin Val - Gly - Ser - Ala ) ile yeşil işaretlenmiş amino ucu ( L-Valin ) ve
mavi belirgin karboksil ucunu ( L-Alanin ).

Peptitler ( Yunanca πεπτός, peptós "sindirilmiş"; πέσσειν, péssein "sindirmek" ten türetilmiştir ) peptit bağları ile bağlanmış kısa amino asit zincirleridir . On veya on beşten az amino asitten oluşan zincirlere oligopeptitler denir ve dipeptitleri, tripeptitleri ve tetrapeptitleri içerir .

Bir polipeptit, daha uzun, sürekli, dallanmamış bir peptit zinciridir. Bu nedenle peptitler, nükleik asitler, oligosakaritler, polisakaritler ve diğerlerinin yanı sıra biyolojik polimerlerin ve oligomerlerin geniş kimyasal sınıflarına girer .

Yaklaşık elliden fazla amino asit içeren bir polipeptit, protein olarak bilinir . Proteinler, genellikle koenzimler ve kofaktörler gibi ligandlara veya DNA veya RNA gibi başka bir proteine ​​veya başka makromoleküle veya karmaşık makromoleküler düzeneklere bağlı, biyolojik olarak işlevsel bir şekilde düzenlenen bir veya daha fazla polipeptitten oluşur .

Peptidlere dahil edilen amino asitlere kalıntılar denir . Her amid bağının oluşumu sırasında bir su molekülü açığa çıkar . Siklik peptitler dışındaki tüm peptitler, peptitin sonunda bir N-terminali (amin grubu) ve C-terminali (karboksil grubu) kalıntısına sahiptir (resimde tetrapeptit için gösterildiği gibi).

sınıflar

Pek çok peptit türü bilinmektedir. Kaynaklarına ve işlevlerine göre sınıflandırılmış veya kategorize edilmiştir. Biyolojik Olarak Aktif Peptidler El Kitabına göre, bazı peptit grupları arasında bitki peptitleri, bakteri/ antibiyotik peptitleri, mantar peptitleri, omurgasız peptitleri, amfibi/deri peptitleri, zehir peptitleri, kanser/kanser peptitleri, aşı peptitleri, bağışıklık/enflamatuar peptitler, beyin bulunur. peptitler, endokrin peptitler, sindirim peptitleri, gastrointestinal peptitler, kardiyovasküler peptitler, renal peptitler, solunum peptitleri, opiat peptitler, nörotrofik peptitler ve kan-beyin peptitleri.

Bazı ribozomal peptitler proteolize tabidir . Bunlar tipik olarak daha yüksek organizmalarda hormonlar ve sinyal molekülleri olarak işlev görür . Mikrosinler ve bakteriyosinler gibi bazı organizmalar antibiyotik olarak peptitler üretir .

Peptitler sıklıkla fosforilasyon, hidroksilasyon, sülfonasyon, palmitoilasyon, glikosilasyon ve disülfid oluşumu gibi translasyon sonrası modifikasyonlara sahiptir . Kement yapıları gözlemlenmiş olmasına rağmen, genel olarak peptitler doğrusaldır . Platypus zehirinde L-amino asitlerin D-amino asitlere rasemizasyonu gibi daha egzotik manipülasyonlar meydana gelir .

Ribozomal olmayan peptitler, ribozom tarafından değil, enzimler tarafından birleştirilir . Yaygın bir ribozomal olmayan peptit, çoğu aerobik organizmanın antioksidan savunmasının bir bileşeni olan glutatyondur . Diğer ribozomal olmayan peptitler, tek hücreli organizmalar, bitkiler ve mantarlarda en yaygın olanıdır ve ribozomal olmayan peptit sentetaz adı verilen modüler enzim kompleksleri tarafından sentezlenir .

Bu kompleksler genellikle benzer bir şekilde düzenlenir ve gelişmekte olan ürün üzerinde çeşitli kimyasal manipülasyonlar gerçekleştirmek için birçok farklı modül içerebilirler. Bu peptitler genellikle sikliktir ve lineer ribozomal olmayan peptitler de yaygın olmasına rağmen oldukça karmaşık siklik yapılara sahip olabilir. Sistem, yağ asitleri ve poliketidler oluşturmaya yönelik makinelerle yakından ilişkili olduğundan, genellikle hibrit bileşikler bulunur. Oksazollerin veya tiyazollerin varlığı genellikle bileşiğin bu şekilde sentezlendiğini gösterir.

Peptonlar, hayvan sütünden veya proteoliz ile sindirilen etten elde edilir. Küçük peptitler içermesine ek olarak, elde edilen materyal yağlar, metaller, tuzlar, vitaminler ve diğer birçok biyolojik bileşiği içerir. Peptonlar, besin ortamında bakteri ve mantar yetiştirmek için kullanılır.

Peptit fragmanları, kaynak proteini tanımlamak veya ölçmek için kullanılan protein fragmanlarını ifade eder. Bunlar genellikle laboratuvarda kontrollü bir numune üzerinde gerçekleştirilen enzimatik bozunmanın ürünleridir, ancak doğal etkilerle bozunmuş adli veya paleontolojik numuneler de olabilir.

kimyasal sentez

Amino asitler tablosu
Fmoc -α- amin korumalı amino asit kullanılarak bir pist amid reçinesi üzerinde katı fazlı peptit sentezi

Örnek aileler

Bu bölümdeki peptit aileleri, genellikle hormonal aktiviteye sahip ribozomal peptitlerdir. Bu peptitlerin tümü, hücreler tarafından daha uzun "propeptitler" veya "proproteinler" olarak sentezlenir ve hücreden çıkmadan önce budanır. Sinyal işlevlerini yerine getirdikleri kan dolaşımına salınırlar.

Antimikrobiyal peptitler

taşikinin peptitleri

Vazoaktif bağırsak peptitleri

  • VIP ( V asoactive I ntestinal p Polipeptid ; PHM27)
  • PACAP p ituitary bir denylate yclase bir ctivating p Polipeptid
  • Peptid PHI 27 ( p Polipeptid H istidine I soleucine 27 )
  • GHRH 1-24 ( G rowth lH ormone R eleasing H ormone 1-24)
  • glukagon
  • sekretin

Pankreas polipeptidi ile ilgili peptidler

  • NPY ( N euro P eptid Y )
  • PYY ( p Polipeptid YY )
  • APP ( bir vian P ancreatic P olypeptide)
  • PPy P ancreatic P ol Y peptidi

opioid peptitler

kalsitonin peptitleri

Kendiliğinden Birleşen Peptitler

Diğer peptitler

terminoloji

Uzunluk

Peptidlerle ilgili birkaç terimin kesin uzunluk tanımları yoktur ve kullanımları genellikle örtüşür.

  • Bir polipeptit, amid bağlarıyla bir arada tutulan birçok amino asidin (herhangi bir uzunlukta) tek bir lineer zinciridir .
  • Bir protein, bir veya daha fazla polipeptitten (yaklaşık 50 amino asitten daha uzun) oluşur.
  • Bir oligopeptit, yalnızca birkaç amino asitten (iki ile yirmi arasında) oluşur.
Bir tripeptit (örneğin, Val - Gly - Ala ) ile
yeşil işaretlenmiş amino ucuna ( L-Valin ) ve
mavi belirgin karboksil ucundan ( L-Alanin )

Amino asit sayısı

Tanımlanmış uzunluktaki peptitler, IUPAC sayısal çarpan önekleri kullanılarak adlandırılır .

İşlev

  • Bir nöropeptid, nöral doku ile birlikte aktif olan bir peptittir.
  • Bir lipopeptit, kendisine bağlı bir lipide sahip bir peptittir ve pepdusinler, GPCR'ler ile etkileşime giren lipopeptitlerdir.
  • Bir peptid hormonu, bir olarak hareket eden bir peptiddir hormon .
  • Bir proteoz proteinlerin hidrolizi ile üretilen peptidlerin bir karışımıdır. Terim biraz arkaik.
  • Bir peptiterjik ajan (veya ilaç), vücuttaki veya beyindeki peptit sistemlerini doğrudan modüle etme işlevi gören bir kimyasaldır. Bir örnek, nöropeptiderjikler olan opioiderjiklerdir .
  • Hücreye nüfuz eden peptit, hücre zarına nüfuz edebilen bir peptittir.

Ayrıca bakınız

Referanslar